在处理已签解除协议后公司要求系统提交离职申请的问题时，以下特殊情况或例外情形可能会对处理结果造成影响。1、解除协议存在瑕疵或未生效：如果解除劳动合同协议未明确解除时间、未约定经济补偿等关键条款，或协议未经双方签字盖章，此时公司要求系统提交离职申请可能被视为完善解除程序的必要步骤，您可能需要配合提交以确保劳动关系合法解除。2、公司内部规章制度有明确规定：若公司合法有效的规章制度中明确规定，协商解除劳动合同也必须通过系统提交离职申请并完成审批流程，且该规定已向您公示或告知，那么公司的要求可能具有一定合理性，您需在不违反协议约定的前提下考虑是否遵守。3、系统提交内容可能影响权益：如果系统离职申请模板中存在“自愿离职”“放弃经济补偿”等默认条款，提交此类申请可能与解除协议中约定的补偿内容相冲突，导致您丧失应得权益，此时需特别谨慎并与公司协商修改申请内容。
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您的问题“已经协商离职并签了解除劳动合同协议，公司还要求系统提交离职申请怎么办？”，其法律依据主要来自《中华人民共和国劳动合同法》。《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条规定：“用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。”在您的情况中，您与公司已协商离职并签订了解除劳动合同协议，这符合该条款中“协商一致解除劳动合同”的情形。该协议一旦双方签字或盖章，即对双方产生法律约束力，标志着劳动关系的解除。系统提交离职申请通常是公司内部管理流程，若解除协议已明确劳动关系解除的时间和相关事宜，公司不能以未提交系统申请为由否定协议的效力。因此，在协议有效的前提下，您有权拒绝公司额外的、不必要的系统申请要求，除非协议本身对此有明确约定。
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您已协商离职并签协议，公司要求系统提交离职申请的情况可能存在以下法律风险点。1、协议效力被否定的风险：如果您在系统提交的离职申请中填写的离职原因、时间等内容与已签的解除协议不一致，公司可能以此为由主张解除协议无效，进而引发关于劳动关系解除的争议。例如，协议约定公司支付经济补偿，但系统申请写为“个人原因自愿离职”，公司可能据此拒绝支付补偿。2、举证困难的风险：若您未保留与公司关于系统申请要求的沟通记录，且未在提交申请时进行备注说明其与协议的关系，一旦公司事后否认协议效力或主张您未完成离职手续，您可能因证据不足而难以维护自身权益。
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您已经协商离职并签了解除劳动合同协议，公司仍要求系统提交离职申请，这需要结合协议具体内容判断。如果解除劳动合同协议中已明确约定双方劳动关系解除的条件、时间及相关权利义务，且协议内容不违反法律强制性规定，那么该协议本身即具有法律效力，双方劳动关系已依法解除，公司要求额外提交系统离职申请可能属于重复或不必要的程序。若解除劳动合同协议对劳动关系解除的生效时间或程序有特殊约定，例如约定以系统提交离职申请并审批完成为生效条件，那么您可能需要按照协议约定履行系统提交离职申请的义务，以确保解除行为的完全生效。您已经协商离职并签了解除劳动合同协议，公司仍要求系统提交离职申请，这需要结合协议具体内容判断。如果解除劳动合同协议中已明确约定双方劳动关系解除的条件、时间及相关权利义务，且协议内容不违反法律强制性规定，那么该协议本身即具有法律效力，双方劳动关系已依法解除，公司要求额外提交系统离职申请可能属于重复或不必要的程序。若解除劳动合同协议对劳动关系解除的生效时间或程序有特殊约定，例如约定以系统提交离职申请并审批完成为生效条件，那么您可能需要按照协议约定履行系统提交离职申请的义务，以确保解除行为的完全生效。

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